治療している歯以外の歯が痛む

虫歯がいくつかあると言われて治療を始めてから､他の歯や歯茎が痛むようになりました｡
うまく表現できないのですが､虫歯を治療したことで他の場所の虫歯菌が活発になった？…という感じです｡一番最初に受診したときにレントゲン撮って説明をしてもらったんですが､親不知が隠れている歯茎が疲れてる時に腫れると言われました｡その場所がほとんど毎日痛みます｡
虫歯の治療も少しずつ進めていますが､飛び火でもするように次々と他の歯が痛みだします｡自分の目で見て虫歯という感じではないのですが､痛みはあります｡これは噛み合わせの問題でしょうか｡歯医者に通うようになって歯磨きにも気を遣うようになり､カラーテスターでチェックして磨き残しが無いようにしています｡歯磨きは前より入念にするようになったのに､どうしていろいろな所が痛むのか､納得できません｡歯科医院を変えた方が良いのでしょうか。